Environ 16 millions d’Américains souffrent de MPOC, un groupe d’affections pulmonaires qui comprend l’emphysème et la bronchite chronique.
Les chercheurs d’UVA Health et leurs collaborateurs ont développé une meilleure façon de prédire le risque de maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC), une forme progressive et potentiellement mortelle d’inflammation pulmonaire, pour les personnes d’ascendance non européenne.
Les premiers tests du nouvel outil plus inclusif ont révélé qu’il est plus efficace pour prédire le risque de MPOC pour les Afro-Américains et les gros fumeurs que les modèles existants basés sur des informations génétiques largement collectées auprès de personnes d’ascendance européenne. Les développeurs de l’outil affirment que leur approche permettra aux médecins de mieux prédire le risque de MPOC pour les personnes d’ascendance diverse aux États-Unis et dans le monde.
“Notre étude démontre la possibilité d’apprendre à partir d’études génétiques à grande échelle réalisées principalement dans des groupes d’ascendance européenne, puis de développer des modèles de prédiction qui peuvent être utilisés pour prédire le risque génétique dans d’autres groupes d’ascendance”, a déclaré le chercheur Ani W. Manichaikul, PhD, de l’École de médecine de l’Université de Virginie. “Alors que l’étude actuelle se concentre sur la prédiction du risque de MPOC, nous cherchons déjà à appliquer des approches similaires pour améliorer la prédiction du risque génétique pour d’autres maladies.”
À propos de la MPOC :
Bien que traitable, la MPOC est l’une des principales causes de décès aux États-Unis et dans le monde. Environ 16 millions d’Américains souffrent de MPOC, qui est un groupe d’affections pulmonaires comprenant l’emphysème et la bronchite chronique. Les lésions pulmonaires causées par la MPOC sont irréversibles et s’accumulent avec le temps. Cela rend la détection et le traitement précoces particulièrement importants.
Ces dernières années, les médecins ont été en mesure de prédire le risque génétique des patients de développer une MPOC et d’autres maladies courantes en utilisant ce qu’on appelle les «scores de risque polygéniques» ou PRS. Ceux-ci examinent le nombre total de variations génétiques naturelles d’une personne qui la prédisposent à une maladie – dans ce cas, la MPOC. À ce jour, la plupart des études génétiques à grande échelle disponibles pour l’étude du risque de maladie ont une représentation limitée de certains groupes d’ascendance, y compris les Afro-Américains et les Hispaniques, ce qui donne une prédiction plus faible du risque de maladie pour ces groupes.
Manichaikul et ses collaborateurs ont cherché à améliorer la capacité de prédire la MPOC en reflétant mieux la diversité génétique mondiale. Pour ce faire, ils ont superposé des mesures génétiques à d’autres mesures moléculaires d’un groupe d’ascendance diversifié qui comprenait une combinaison d’ascendance européenne, d’individus afro-américains et hispaniques des États-Unis. En s’appuyant sur ces ressources, ils ont développé ce qu’ils appellent le « score de risque du transcriptome polygénique dérivé de PrediXcan », ou PTRS. Cette nouvelle approche intègre beaucoup plus d’informations sur les effets cumulatifs des variations génétiques dans différents groupes de personnes. Le résultat est un modèle qui “a un lien plus direct avec la biologie de la maladie sous-jacente que les approches PRS standard”, rapportent les chercheurs dans un nouvel article scientifique.
Les scientifiques ont mis leur nouvel outil à l’épreuve en analysant sa capacité à prédire la BPCO chez des dizaines de milliers de participants dans des études menées par le programme Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) parrainé par le National Heart, Lung and Blood des National Institutes of Health. Institut (NHLBI).
Ils ont découvert que le PTRS était meilleur pour prédire la MPOC chez les Afro-Américains et mieux pour prédire la MPOC modérée à sévère chez les gros fumeurs de longue date. Peut-être sans surprise (étant donné qu’il a été développé pour mieux refléter les populations non européennes), le PTRS était moins efficace que le PRS pour prédire la MPOC chez les personnes d’ascendance européenne. Mais la disponibilité de plusieurs « boules de cristal » pour prédire la MPOC dans différentes populations nous rapproche d’une véritable médecine de précision – une médecine adaptée à chaque individu.
“Jusqu’à présent, nous avons montré qu’en nous appuyant sur des données génomiques combinées à des données d’expression génique provenant d’individus d’ascendance diverse, nous pouvons améliorer la prédiction du risque génétique pour certaines personnes”, a déclaré Manichaikul, du Centre de génomique de la santé publique et du Département de la santé publique de l’UVA. Les sciences. « Dans l’avenir, nous sommes ravis de réfléchir à la manière dont nous pouvons nous appuyer sur d’autres collections de données moléculaires provenant d’individus d’ascendance diverse et continuer à travailler sur des approches améliorées pour la prédiction du risque génétique pour d’autres maladies.
Résultats publiés :
Les chercheurs ont décrit leur outil dans l’American Journal of Human Genetics. L’équipe de recherche comprenait Xiaowei Hu, Stephen S. Rich et Manichaikul de l’UVA. Hu, Rich et Manichaikul n’ont déclaré aucun conflit d’intérêts lié au travail. Une liste complète des divulgations est incluse dans le document.
Le travail a été financé par les subventions NHLBI R01 HL131565, R01 HL153248, R01 HL135142, R01 HL137927, R01 HL089856, R01 HL147148 et K01-HL129039.
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