par Leigh MacMillan :
Selon une paire d’études récentes, la combinaison de tests génétiques avec des informations provenant de dossiers de santé électroniques peut révéler des troubles du rythme cardiaque non diagnostiqués et de nouvelles conditions associées à des mutations géniques du cancer héréditaires.
Les résultats renforcent l’utilisation croissante des informations génétiques dans les soins cliniques, a déclaré Dan Roden, MD, vice-président principal de la médecine personnalisée au Vanderbilt University Medical Center et auteur principal de l’étude sur l’arythmie publiée dans la revue Circulation:.
Les nouveaux rapports s’appuient sur les données du réseau eMERGE (Electronic Medical Records and Genomics), un consortium national organisé et soutenu par le National Human Genome Research Institute, qui fait partie des National Institutes of Health. VUMC a servi à la fois de site de réseau et de centre de coordination national depuis le lancement d’eMERGE en 2007.
Pour les dernières études, eMERGE a recruté près de 25 000 personnes sur 10 sites du réseau et a séquencé un panel personnalisé de 109 gènes. L’objectif, a déclaré Roden, était d’identifier les personnes atteintes de maladies mendéliennes non reconnues (maladies résultant de la mutation d’un seul gène) et de leur renvoyer cette information.
Dans l’ensemble, le consortium a constaté qu’environ 3 % des participants avaient une variante pathogène ou probablement pathogène (P/LP) associée à la maladie dans l’un des gènes.
Maintenant, dans le : Circulation: étude menée par Andrew Glazer, PhD, et Giovanni Davogustto, MD, au VUMC, les chercheurs ont examiné de plus près 10 des gènes associés aux troubles du rythme cardiaque.
« Les questions que nous avons posées étaient : combien de personnes – qui n’avaient aucune indication antérieure pour les tests génétiques cardiaques – avaient des variantes pathogènes ou probablement pathogènes ; et combien de ces personnes avaient réellement un phénotype dans les dossiers de santé électroniques ? » dit Roden.
Parmi 21 846 participants, ils ont découvert que 120 (0,6 %) avaient des variants P/LP dans les gènes associés à l’arythmie. Dans l’analyse des dossiers de santé électroniques, ils ont trouvé un pourcentage plus élevé de phénotypes d’arythmie chez les individus avec des variantes P / LP, par rapport à ceux sans les variantes.
L’équipe a pu renvoyer les résultats à 54 participants et, avec un suivi clinique, poser 19 diagnostics de syndromes d’arythmie héréditaire.
En plus des variants P/LP, les chercheurs ont découvert que 1 838 individus (8,4 %) avaient des « variants de signification incertaine » (VUS) dans un gène associé à l’arythmie. Les VUS posent un défi à la médecine génomique, a déclaré Roden, car leur contribution à la maladie est inconnue.
Dans l’ensemble, les porteurs de VUS n’avaient pas plus de phénotypes d’arythmie de dossier de santé électronique que les non-porteurs, mais 116 VUS se sont produits chez au moins un participant présentant un phénotype d’arythmie. Les chercheurs ont sélectionné 50 de ces VUS pour les étudier in vitro en utilisant l’électrophysiologie patch clamp à haut débit (pour évaluer les effets de la variante sur la fonction des protéines). Ils ont pu reclasser 11 variantes : trois à probablement bénignes et huit à P/LP.
Une autre étude, publiée dans : JAMA Oncologie : et dirigé par Chenjie Zeng, PhD, MPH, et Joshua Denny, MD, au NHGRI, a exploré le spectre des maladies associées aux syndromes de cancer héréditaire en utilisant les données d’eMERGE et de deux autres grandes cohortes.
Les chercheurs, dont Lisa Bastarache, MS, Georgia Wiesner, MD, et d’autres au VUMC, ont mené une étude d’association à l’échelle du phénome pour trouver des phénotypes de dossiers de santé électroniques associés à des variantes P / LP dans 23 gènes de cancer héréditaires. En plus de répliquer les associations gène-cancer établies, ils ont identifié 19 nouvelles associations : sept pour différents cancers et 12 pour des affections telles que les kystes ovariens, la pancréatite aiguë et la gastrite chronique. Les résultats pourraient faciliter la détection précoce et une meilleure gestion des cancers, ont noté les chercheurs.
“Le message à retenir est que 3% des personnes porteront une variante pathogène ou probablement pathogène dans un gène pathogène et de nombreuses autres porteront des variantes de signification incertaine”, a déclaré Roden. “Nous pouvons utiliser des tests génétiques, des phénotypes de dossiers de santé électroniques et des technologies in vitro pour évaluer et trouver des personnes atteintes d’une maladie génétique non reconnue et sauver des vies en établissant des diagnostics plus précoces.”
Roden, titulaire de la chaire dotée Sam L. Clark, MD, PhD, est professeur de médecine, de pharmacologie et d’informatique biomédicale et directeur de l’Institut John A. Oates de thérapeutique expérimentale. Glazer est professeur adjoint de médecine et Davogustto est instructeur en médecine. La recherche a été soutenue par des subventions du NIH et de l’American Heart Association.
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