Des chercheurs australiens cartographient le génome de la crevette tigrée :

La cartographie du génome de la crevette tigrée peut relancer les efforts de création de stocks d’élevage plus grands et plus résistants aux maladies :

Les chercheurs de l’Université James Cook ont ​​participé au tout premier effort réussi pour cartographier le génome d’une espèce de fruits de mer australienne emblématique – celle de la crevette tigrée noire australienne – qui pourrait conduire à l’avenir à un stock d’élevage plus grand et plus résistant aux maladies.

Dean Jerry, professeur d’aquaculture à la JCU, a déclaré que la recherche était issue de l’ARC Industrial Transformation Research Hub for Advanced Breeding, une collaboration entre la JCU, l’Australian Genome Research Facility (AGRF), l’Université de Sydney, le CSIRO et le Seafarms Group. Le partenariat visait à améliorer la productivité et l’efficacité de l’élevage de crevettes grâce à l’utilisation de la sélection génétique.

L’aquaculture est une source de plus en plus importante de produits de la mer sûrs, nutritifs et durables pour les populations du monde entier. À l’échelle mondiale, la production aquacole doit doubler d’ici 2030 pour suivre le rythme de la demande. Ces augmentations de la demande de produits aquacoles, les considérations de sécurité alimentaire et la création d’emplois ont généré un besoin accru de travailleurs qualifiés.

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« L’idée était d’améliorer la capacité des éleveurs de crevettes australiens à appliquer des pratiques d’élevage sélectif pour produire des crevettes d’élevage plus grandes et plus saines. Dans le cadre de ce projet, nous avons entrepris de séquencer le génome de la crevette tigrée noire. Les informations contenues dans le génome sont importantes pour nous, car elles contiennent essentiellement le plan qui détermine la composition et le comportement de la crevette », a déclaré le professeur Jerry.

Il a déclaré que l’un des avantages d’avoir ce génome est qu’il peut considérablement aider les efforts de reproduction sélective des crevettes, comme ce qui s’est passé avec le bétail et les espèces cultivées au cours des derniers milliers d’années.

“La crevette est un animal minuscule, mais son génome est presque aussi grand que celui d’un humain, et sa structure est beaucoup plus compliquée”, a déclaré le professeur Jerry.

Le directeur de la bioinformatique de l’AGRF, le Dr Kenneth Chan, a déclaré que le processus de cartographie génétique pour reconstruire le génome de la crevette tigrée noire était diaboliquement délicat.

“Imaginez la tâche d’assembler un puzzle double face de 1,9 milliard de pièces sans bordures, de longues sections répétées qui se chevauchent, des millions de pièces manquantes, plusieurs pièces pouvant tenir au même endroit, aucune image sur la boîte à suivre, et peut-être beaucoup de pièces d’un autre puzzle sans rapport », a déclaré le Dr Chan.

personne tenant une crevette tigrée :
la cartographie du génome relèvera de toute une série de domaines complémentaires, dont l’ingénierie de précision du génome et d’autres études biologiques :

Les scientifiques ont également découvert quelque chose de très inhabituel dans la manière dont la crevette tigrée combattait les infections virales.

Le Dr Nick Wade, chercheur principal au CSIRO, a expliqué que les éléments viraux du génome qui aident à combattre les infections virales (connus sous le nom d’élément viral endogène ou EVE) sont vraiment uniques dans la crevette tigrée australienne.

“Aucun EVE trouvé chez un autre animal ne ressemble à ceci”, a déclaré le Dr Wade.

“La découverte de cet EVE permet de poursuivre les recherches sur la façon dont les crevettes gèrent les infections par des virus et peut-être sur de nouvelles thérapies qui peuvent être appliquées pour rendre les crevettes plus résistantes aux maladies virales”, a-t-il déclaré.

Le professeur Jerry a déclaré que les avantages de la cartographie du génome viendront dans toute une gamme de domaines complémentaires.

“Cela change radicalement le paysage de la recherche sur les crevettes, permettant toute une série d’autres études biologiques fonctionnelles, y compris sur la façon de cibler des gènes particuliers pour de meilleurs résultats de sélection, jusqu’à l’ingénierie du génome de précision”, a déclaré le professeur Jerry.

La vidéo peut être visionnée ici.

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