De nouveaux outils génétiques améliorent le sauvetage potentiel de l’oiseau d’État en voie de disparition de Victoria :

« Helena », le méliphage casqué (Lichenostomus melanops cassidix) dont le génome a été séquencé à la Yellingbo Nature Conservation Reserve (Victoria, Australie). Crédit: Nick Bradsworth :

Une équipe dirigée par des scientifiques de l’Université Monash a franchi une étape importante dans le sauvetage du méliphage casqué, en danger critique d’extinction, emblème de l’État australien de Victoria. Les scientifiques ont déchiffré le génome de l’oiseau et créé des informations génétiques supplémentaires qui ouvrent un moyen supplémentaire d’améliorer potentiellement la santé génétique de ces oiseaux. Ces nouveaux outils permettront aux chercheurs de surveiller la santé et l’impact de l’élevage du méliphage casqué avec une autre sous-espèce. Le méliphage casqué rejoint également un très petit ensemble d’oiseaux qui ont à la fois un génome de longueur chromosomique et une carte génétique. Cette recherche a été publiée aujourd’hui dans la revue scientifique ouverte : GigaScience :.

La population de méliphages casqués a fortement diminué au cours des 200 années écoulées depuis l’arrivée des non-indigènes en Australie. Dans les années 1980, il ne restait plus qu’une cinquantaine d’oiseaux, qui se trouvaient tous au même endroit dans la réserve de conservation de la nature de Yellingbo. L’utilisation d’efforts de conservation standard, qui comprennent la restauration de l’habitat et un programme d’élevage en captivité, a augmenté la population à environ 250 individus. Cependant, ces activités ne seront probablement pas suffisantes pour assurer un avenir à long terme au méliphage casqué. Un problème majeur est que la petite population restante comprend principalement des oiseaux étroitement apparentés avec de faibles niveaux de variation génétique. En conséquence, la consanguinité est courante, produisant une progéniture qui a tendance à mourir jeune et à ne pas bien se reproduire. Une petite taille de population conduit également souvent à l’accumulation de mutations nuisibles. Ainsi, même si les conditions environnementales peuvent être améliorées, ces problèmes génétiques rendront toujours la population vulnérable à l’extinction en raison d’une reproduction inefficace et d’une faible survie, en particulier si elle est affectée par des épidémies et d’autres défis.

Pour améliorer la santé génétique du méliphage casqué, une équipe de scientifiques, d’agences environnementales et de groupes communautaires travaillent ensemble pour créer un programme de “sauvetage génétique” en introduisant des gènes d’une sous-espèce en dehors du petit pool génétique de la population en voie de disparition.

Dr. Alexandra Pavlova, membre de l’équipe de recherche de l’Université Monash, explique que “le méliphage casqué étant le dernier du genre, l’augmentation génétique doit provenir de différentes sous-espèces. Cependant, ce type de mélange génétique n’est pas courant : les responsables de la conservation évitent généralement croisant des sous-espèces de peur de perdre l’adaptation locale et la distinction. »

Ces problèmes peuvent désormais potentiellement être évités compte tenu de la disponibilité de la première séquence génomique de longueur chromosomique pour le méliphage casqué – c’est-à-dire que la qualité des données est si élevée que les séquences assemblées des «lettres» génétiques couvrent des chromosomes entiers plutôt que le séquences génomiques plus couramment disponibles qui sont moins complètes et continues. De plus, les chercheurs ont également produit une carte génétique à haute densité, qui comprend plus de 50 000 positions de marqueurs. Une carte génétique avec autant de marqueurs permet aux scientifiques de suivre exactement quelle partie de chaque chromosome d’un individu a été héritée de chaque parent. La nouvelle séquence du génome et la nouvelle carte génétique seront utilisées pour guider le processus de “mélange” d’ADN provenant de l’extérieur du réservoir actuel de gènes du méliphage casqué. Ensemble, ces outils peuvent servir de moyen pour éclairer les décisions de sélection prises pendant l’effort de sauvetage génétique et permettre que cela soit fait avec une grande précision.

L’auteur principal Diana Robledo-Ruiz explique que “la séquence du génome et la carte génétique seront utilisées pour trouver le bon équilibre entre le sauvetage du méliphage casqué de l’extinction par la consanguinité, tout en conservant les caractéristiques uniques qui en font un méliphage casqué”.

La disponibilité de ressources génomiques aussi exceptionnelles ouvre un nouveau chapitre pour le sauvetage du méliphage casqué. Cependant, sans la passion, l’engagement et le travail de centaines de personnes et de nombreuses organisations, le méliphage casqué serait déjà éteint.

Le professeur Paul Sunnucks, co-auteur de l’étude, déclare que “ce soutien inclut les agences gouvernementales fédérales et étatiques, y compris le ministère de l’Environnement, des Terres, de l’Eau et de la Planification (DELWP) et Zoos Victoria. Certaines personnes telles que Bruce Quin du DELWP ont consacré 30 ans ou plus aux efforts de conservation de l’espèce, et un groupe communautaire très efficace, The Friends of the Helmeted Honeyeater, a fourni une gamme d’assistance pour le programme de conservation pendant plus de trois décennies. et faire une réelle différence pour les résultats en matière de biodiversité ”


Réparer les effets néfastes de la consanguinité pourrait sauver l’emblématique Méliphage casqué :


Plus d’information:
Assemblage du génome de longueur chromosomique et carte de liaison d’un oiseau australien en danger critique d’extinction : Le méliphage casqué, GigaScience : (2022). EST CE QUE JE: 10.1093 / gigascience / giac025 :

Fourni par GigaScience :

Citation:: De nouveaux outils génétiques améliorent le sauvetage potentiel de l’oiseau d’État en voie de disparition de Victoria (2022, 28 mars) récupéré le 28 mars 2022 sur https://phys.org/news/2022-03-genetic-tools-potential-victoria-endangered.html

Ce document est soumis au droit d’auteur. En dehors de toute utilisation loyale à des fins d’étude ou de recherche privée, aucune partie ne peut être reproduite sans l’autorisation écrite. Le contenu est fourni seulement pour information.

Leave a Comment